Lembaga ini mengelola berbagai aspek peningkatan mutu pendidikan di Indonesia. Adapun beberapa program unggulan LPP adalah:

1. Program Peningkatan Kompetensi Mutu Guru

2. Program Pembinaan Siswa

3. Program Pendampingan Sekolah

4. Program Pendampingan Sekolah Bermutu